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Scripts made in Brasil. Therefore, the information below is in Portuguese.

Todos os scripts foram criados e modificados a partir de http://biopython.org/.

Soluções: 1 Busca por sequência de nucleotídeos no NCBI e baixa; 2 Baixa várias sequências do Genbank, incluindo variações do arquivo de saída; 3 Conversão de arquivos (genbank, fasta, nexus); 4 Oculta número de acesso gb; 5 Alinha com Muscle ou Mafft; 6 Concatena (combina) matrizes em formato nexus.

Requerimentos: programa python2 e complemento biopython.

Plataformas: Linux, Windows, Mac, e qualquer uma que suporte compilador/interppretador python.

Execução dos scripts: 1 colocar o arquivo de sequências dentro da pasta onde se localiza o script a ser executado; 2 abrir terminal/prompt dentro da pasta escolhida 3 comando: python nome_do_script. Ex.: python BaixarSeq_ComGB.py

Divirta-se!

Espero que uma alma boa me entregue uma solução (preferivelmente em python) para converter gaps terminais em dados faltantes (gaps to missing) e vice-versa. No momento, a única solução que eu conheço está no Mesquite.

Tiago Andrade Borges Santos.